Les filière Masters Sciences et Techniques accrédités à La FST de Beni Mellal sont :
- Informatique Décisionnelle:
- Master Génie Mathématique & Applications
- Master Géomatique Environnementale
- Master Santé et Environnement
- Master d'Analyse Mathématique Avancée:
- Master Techniques d'Analyse et Contrôle Qualité en Industries Agro-alimentaires:
- Master Ingénierie des Matériaux option 1: Matériaux Organique, Polyméres et Formulation:
- Master Ingénierie des Matériaux option 2: Génie Chimie des Matériaux
- Master Management de la Qualité dans les industries Agro-Alimentaire:
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